ISSN 2359-5191

10/11/2004 - Ano: 37 - Edição Nº: 18 - Ciência e Tecnologia - Instituto de Matemática e Estatística
Plataforma de Integração auxilia pesquisa genética
Software centraliza utilização de programas por pesquisadores

São Paulo (AUN - USP) - Os professores Alan Durhan, do Instituto de Matemática e Estatística (IME-USP), e Arthur Gruber, do Instituto de Biociências, concluíram o EGEne, uma plataforma de integração de resultados decorrentes de dois anos de trabalho. O EGEne consiste num software que permite ao pesquisador das cadeias de DNA e RNA utilizar com muito mais facilidade os diversos softwares necessários ao trabalho, sem conhecer a fundo cada um deles.

O trabalho de mapeamento genético envolve diversas fases. É necessário mapear os genes, eliminar os genes mapeados erroneamente, buscar semelhanças com outros organismos. Cada uma dessas atividades utiliza um ou vários softwares diferentes. O EGEne garante um relacionamento mais fácil entre eles, facilitando o trabalho da equipe de pesquisa, que ganha tempo e reduz custos.

A plataforma integradora dos professores Durhan e Gruber já está sendo utilizada em três laboratórios, e prepara-se para um lançamento em larga escala. O EGEne será disponibilizado gratuitamente na internet, já que o projeto, que tem apoio do CNPq e da Fapesp, visa auxiliar o desenvolvimento da tecnologia nacional na área genética.

Além disso, Durhan desenvolve outros projetos visando os mesmos objetivos. Assim, está trabalhando no desenvolvimento de um Anotador e de um Preditor de Genes. O primeiro dos softwares ajuda no processo de descoberta do funcionamento do DNA. O segundo auxilia os pesquisadores a classificar os genes descobertos. Ambos os softwares podem ser utilizados através do EGEne.

Durhan também atua com Gramáticas Estocásticas. Esta é a tecnologia que permite a descoberta de novos genes, e há a promessa de mais um software nesta área. Inclusive, o pesquisador promete causar polêmica distribuindo gratuitamente o seu programa, já que o software semelhante é vendido por algo em torno de 20 mil reais.

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